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생물학 및 생명과학 논문: 그림, 다중 패널 플레이트 및 공동저자

실험실 및 컴퓨터 생물학을 위한 실용적인 LaTeX: 다중 패널 그림, 해상도, 보충 자료, 통계 표기 및 서로 덮어쓰지 않는 공동 작업.

생명과학 원고는 숫자 우선입니다. 리뷰어들은 접시를 훑어보기 전에 당신의 산문을 읽으십시오. 그래서 그 인물은 손을 흔들지 않고 주장을 전달해야 합니다. 캡션. 그림을 일류로 취급하면 LaTeX가 이를 잘 처리합니다. 보충제 전에 오전 2시에 붙여넣은 파일 대신 프로젝트 파일 마감일.

Wet-lab과 전산 그룹은 동일한 혼란에 빠졌습니다. 공유되지 않은 패널 스케일 바, 얼룩의 JPEG 아티팩트, 컴파일에 실패한 보충 자료 및 한 문단을 편집하는 12명의 공동저자. 아래는 실제로 작동하는 것입니다.

다중 패널 그림

검토자는 하나의 캡션 아래에 (a)(b)(c) 패널이 있을 것으로 기대합니다. 다음 중 하나를 수행할 수 있습니다.

  1. TeX(Illustrator, Inkscape, Fiji 내보내기) 외부에서 플레이트를 빌드하고 드롭합니다. 단일 PDF 또는 PNG로 또는
  2. 각 패널이 자체 파일인 경우 subcaption을 사용하여 TeX에서 어셈블합니다.
\usepackage{subcaption}
\begin{figure}[htbp]
  \begin{subfigure}{0.48\textwidth}
    \includegraphics[width=\linewidth]{a.pdf}
    \caption{Control}\label{fig:exp-a}
  \end{subfigure}\hfill
  \begin{subfigure}{0.48\textwidth}
    \includegraphics[width=\linewidth]{b.pdf}
    \caption{Treatment}\label{fig:exp-b}
  \end{subfigure}
  \caption{Overall experiment.}\label{fig:exp}
\end{figure}

저널 스타일인 경우에만 텍스트에서 Figure~\ref{fig:exp}a로 패널을 참조하십시오. 그것을 허용합니다. 많은 장소에서는 하나의 구성표가 적용된 “그림 2A”를 선호합니다. 모든 곳에. 해당 패턴에 대한 추가 정보: 패널 a, b, c.

파일 이름을 일관되게 지정하여(fig03_western_a.pdf) 아무도 발명하지 않도록 합니다. final_gel_NEW.png 제출 주.

해상도, 색상, 파일 형식

현미경 아카이브를 고해상도 TIFF 또는 PDF로 보관하십시오. 종이 PDF의 경우 자체적으로 회로도에는 벡터 그래픽을 사용하고 충분한 dpi의 PNG/PDF를 사용하십시오. 래스터 데이터. 라인 주석 및 젤에서 JPEG를 건너뜁니다. 압축 아티팩트 실험이 괜찮을 때에도 엉성한 과학으로 읽혀집니다.

6색 팔레트를 디자인하기 전에 색상 요금과 인쇄 규칙을 확인하세요. 보정된 모니터에서만 작동합니다. 일부 저널에서는 CMYK를 원합니다. 다른 사람들은 개종한다 묻지도 않고 나쁘게. 그레이스케일 안전 버전의 키를 요청할 때 숫자, 그들에게 줘.

캡션뿐만 아니라 패널에도 눈금 막대와 강도 단위를 배치합니다. 만약에 생산 재배치 수치, 내장된 스케일 바는 그대로 유지됩니다. 캡션 전용 메모 종종 그렇지 않습니다.

회로도와 데이터 패널

“경로의 만화”를 “오점의 정량화”와 별도로 유지하십시오. 만화는 TikZ 또는 외부 벡터 아트일 수 있습니다. 데이터 패널은 가까이 있어야 합니다. 검토자가 원할 때 다시 생성할 수 있도록 분석 내보내기 다른 정규화. 캡션 메모 또는 저널에서 허용하는 경우 재현성 보충 자료입니다.

여전히 컴파일되는 보충제

거대한 테이블, 추가 젤 및 영화 스틸은 자체 보충 자료에 속합니다. 문서 또는 명확한 부록. 두통을 덜 수 있는 몇 가지 규칙:

기본 및 보충 자료가 하나의 컴파일을 공유하는 경우 레이블은 고유해야 합니다. 그렇다면 별도의 프로젝트인 경우 “Figure S3”을 일반 텍스트로 작성하고 \ref에 의존하지 마세요. PDF 전반에 걸쳐 어떤 본문 주장이 어느 지점에 있는지에 대한 짧은 목록을 유지하십시오. 보충 품목이므로 아무것도 표류하지 않습니다.

제출한 주에 편집되지 않은 보충 자료는 여전히 귀하의 문제는 기본 PDF가 깨끗해 보이는 경우에도 마찬가지입니다.

다중 저자의 혼란

생물학 논문에는 다양한 LaTeX 기술 수준의 공동저자가 많은 경우가 많습니다. 소유 섹션별 파일(results.tex, methods.tex, figs.tex)을 병합합니다. Git을 실행하고 ‘.bib’(한 사람 또는 공유 Zotero 그룹)을 누가 관리할지 결정합니다. 수출).

클라우드보다 공동작업자가 로컬 프로젝트 폴더를 압축하기가 더 쉽습니다. 졸업 후 프로젝트에 대한 액세스 권한을 잃게 됩니다. 실제 Git 기록이 이메일을 능가합니다. 누군가가 다시 변환하는 manuscript_JM_edits_FINAL.docx라는 첨부 파일 손으로 TeX에. 성공적인 컴파일 후 체크포인트 병합 시 복원 잘못됐어; 개인 리모콘을 보관하세요.

일부 공동저자가 Word만 편집하는 경우 DOCX 또는 PDF로 내보내고 .tex를 유지하세요. 진실의 근원으로서. 참조 Word만 사용하는 공동저자.

방법 및 통계 표기법

p-값이 ’$p$’와 ’$p$’로 모두 표시되지 않도록 통계 매크로를 한 번 정의하세요. 같은 논문의 p=:

\newcommand{\pvalue}[1]{$p = #1$}
\newcommand{\ci}[2]{95\% CI $[#1, #2]$}

방법이나 표에 검정, n, 다중 비교 수정을 명시합니다. 생산 과정에서 잘려지는 그림 범례에만 있는 것이 아닙니다. 조밀한 논문은 짧은 표기 목록을 활용하면 도움이 됩니다. 실시간 참조/인용 확인 연구 편집자는 리뷰어보다 먼저 삭제된 패널에 대한 \ref를 포착합니다.

주장을 담고 있는 캡션

좋은 캡션은 무엇을 측정했는지, 어떤 시스템에서, 독자가 무엇을 측정했는지 알려줍니다. 알아 차려야합니다. “텍스트 보기”를 피하세요. 캡션에 메소드를 덤프하지 마십시오. 방법 섹션에 속합니다. 패널 문자(굵게 또는 괄호)는 다음과 같습니다. 하우스 스타일과 일치합니다.

제출 전 그림 체크리스트

제출을 누르기 전에 수치를 한 번 살펴보세요.

  • 인용된 모든 주요 인물은 순서대로(또는 저널에서 허용하는 순서대로)
  • 라벨이 붙은 패널; 중요한 부분의 스케일 바.
  • 정량 패널에 JPEG 혼란이 없습니다.
  • 보충 컴파일; S 번호가 다시 섞이지 않았습니다.
  • 색상 정책을 확인했습니다. 포털 제한에 따른 파일 크기.
  • 프로젝트 또는 연구실 아카이브에서 소스 이미지와 스크립트를 계속 찾을 수 있습니다.

웨스턴, 젤, 대비

PDF의 오점을 과도하게 처리하지 마십시오. 저널과 독자는 대조를 주목합니다. 게임. 연구실 아카이브에 원시 파일을 보관하고 내용과 일치하는 패널을 배송하세요. 사용된 정량화. 패널을 다시 정렬하는 경우 모든 텍스트 패널을 업데이트하세요. “나중에”가 아니라 당일에 편지를 보내세요.

영화 및 대화형 보충 자료

저널에서 영화를 허용하면 그들이 지시하고 설명하는 방식으로 영화를 호스팅하세요. 여전히 PDF에 캡션이 추가되어 있습니다. 개인 클라우드 링크에 의존하지 마십시오. 졸업 후 사망.

그림은 이 논문의 핵심입니다. LaTeX는 단지 프레임일 뿐입니다. 확인하세요 프레임은 제출 전날 밤에 실패한 것이 아닙니다.

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