Biyoloji ve yaşam bilimleri makaleleri: şekiller, çok panelli plakalar ve ortak yazarlar
Islak laboratuvar ve hesaplamalı biyoloji için pratik LaTeX: çok panelli şekiller, çözünürlük, ekler, istatistik gösterimi ve birbirinin üzerine yazmadan işbirliği.
Yaşam bilimi el yazmaları şekil önceliklidir. Eleştirmenler, incelemeden önce plakaya göz gezdirirler. Yazınızı okuyun, bu yüzden figürün iddiayı el sallamadan taşıması gerekiyor başlık. Rakamlara birinci sınıf muamelesi yaparsanız LaTeX bu sorunu çözer ekten önce gece saat 2’de yapıştıracağınız bir şey yerine proje dosyaları son tarih.
Islak laboratuvar ve hesaplamalı gruplar aynı karmaşaya maruz kalıyor: paylaşımsız paneller ölçek çubukları, lekelerdeki JPEG yapaylıkları, derlenemeyen ekler ve bir paragrafı düzenleyen düzinelerce ortak yazar. Aşağıda aslında işe yarayan şey var.
Çok panelli şekiller
Gözden geçirenler (a)(b)(c) panellerinin tek başlık altında olmasını beklemektedir. Şunlardan birini yapabilirsiniz:
- Plakayı TeX’in (Illustrator, Inkscape, Fiji Export) dışında oluşturun ve bırakın tek bir PDF veya PNG’de veya
- Her panel kendi dosyası olduğunda TeX’te “alt başlık” ile birleştirin:
\usepackage{subcaption}\begin{figure}[htbp] \begin{subfigure}{0.48\textwidth} \includegraphics[width=\linewidth]{a.pdf} \caption{Control}\label{fig:exp-a} \end{subfigure}\hfill \begin{subfigure}{0.48\textwidth} \includegraphics[width=\linewidth]{b.pdf} \caption{Treatment}\label{fig:exp-b} \end{subfigure} \caption{Overall experiment.}\label{fig:exp}\end{figure}Yalnızca günlük stili olması durumunda metinde panellere Şekil~\ref{fig:exp}a olarak bakın buna izin veriyor. Pek çok mekan tek bir şemanın uygulandığı “Şekil 2A”yı tercih ediyor her yerde. Bu model hakkında daha fazlası: paneller a, b, c.
Kimsenin icat etmemesi için dosyaları tutarlı bir şekilde adlandırın (fig03_western_a.pdf)
final_gel_NEW.png gönderim haftası.
Çözünürlük, renk ve dosya formatları
Mikroskopi arşivlerini yüksek çözünürlüklü TIFF veya PDF olarak saklayın. Bildiri PDF’si için şemalar için vektör grafiklerini ve yeterli dpi’de PNG/PDF’yi kullanın. tarama verileri. JPEG çevrimiçi açıklamaları ve jelleri atlayın. Sıkıştırma eserleri deney iyi olsa bile özensiz bilim olarak okuyun.
Altı renkli bir palet tasarlamadan önce renk ücretlerini ve yazdırma kurallarını kontrol edin. yalnızca kalibre edilmiş monitörünüzde çalışır. Bazı dergiler CMYK istiyor; diğerleri dönüştürür sormadan kötü bir şekilde. Anahtarın gri tonlamalı güvenli sürümlerini istediklerinde rakamlar, onlara bunları ver.
Ölçek çubuklarını ve yoğunluk birimlerini yalnızca altyazıya değil, panele de yerleştirin. Eğer üretim yeniden düzenleme rakamları, yerleşik ölçek çubukları varlığını sürdürüyor; yalnızca altyazılı notlar çoğu zaman bunu yapmayın.
Şemalar ve veri panelleri
“Yolun karikatürünü” “leke miktarının belirlenmesinden” ayrı tutun. Karikatürler TikZ veya harici vektör sanatı olabilir. Veri panelleri yakın durmalıdır Analizi dışa aktarın, böylece bir incelemeci bir analiz istediğinde analizleri yeniden oluşturabilirsiniz. farklı normalleştirme. Altyazı notlarındaki analiz komut dosyası yolunu not edin veya dergi izin verdiğinde tekrarlanabilirlik eki.
Hala derlenen takviyeler
Devasa masalar, ekstra jeller ve film görüntüleri kendi ekine aittir belge veya açık bir ek. Baş ağrısını kurtaran birkaç kural:
Ana ve ek bir derlemeyi paylaşıyorsa etiketler benzersiz olmalıdır. eğer öyleyseler projeleri ayrı tutun, “Şekil S3”ü düz metin olarak yazın ve “\ref”e güvenmeyin PDF’ler arasında. Ana metindeki iddiaların hangisini işaret ettiğinin kısa bir listesini tutun öğeleri tamamlayın, böylece hiçbir şey kaymaz.
Gönderim haftasını derlemeyen bir ek hala sizin ana PDF temiz görünse bile sorun.
Çok yazarlı kaos
Biyoloji makalelerinde genellikle farklı LaTeX beceri düzeylerinde birçok ortak yazar bulunur. Sahip
bölümlere göre dosyalar (results.tex, methods.tex, figs.tex), birleştirme
Git ve “.bib” dosyasını kimin elinde tutacağına karar verin (bir kişi mi yoksa paylaşılan bir Zotero grubu mu?)
ihracat).
Bir ortak çalışan için yerel bir proje klasörünü sıkıştırmak, buluttan daha kolaydır
mezun olduktan sonra erişimlerini kaybedecekleri proje. Gerçek Git geçmişi e-postayı yener
birisinin geri dönüştürdüğü manuscript_JM_edits_FINAL.docx adlı ekler
TeX’e elle. Başarılı derlemelerden sonra kontrol noktası; birleştirme sırasında geri yükle
yanlış gidiyor; özel bir uzaktan kumanda bulundurun.
Bazı ortak yazarlar yalnızca Word’ü düzenliyorsa onlar için DOCX veya PDF’yi dışa aktarın ve `.tex’i saklayın gerçeğin kaynağı olarak. Bkz. yalnızca Word konuşan ortak yazarlar.
Yöntemler ve istatistik gösterimi
P değerlerinin hem “$p$” hem de “$p$” olarak görünmemesi için istatistiksel makroları bir kez tanımlayın.
Aynı makalede p=:
\newcommand{\pvalue}[1]{$p = #1$}\newcommand{\ci}[2]{95\% CI $[#1, #2]$}Testi, n’yi ve çoklu karşılaştırma düzeltmesini yöntemlerde veya tabloda belirtin notlar, yalnızca üretimde kırpılan bir figür efsanesinde değil. Yoğun makaleler kısa bir notasyon listesinden yararlanır. Canlı referans/alıntı kontrolü araştırma editörü silinen panele yönelik bir “ref”i incelemeciden önce yakalar.
İddiayı taşıyan başlıklar
İyi bir başlık neyin, hangi sistemde ölçüldüğünü ve okuyucunun ne düşündüğünü belirtir. fark etmeli. “Metni göster” seçeneğinden kaçının. Yöntemleri başlığa bırakmayın yöntemler bölümüne aittir. Panel harfleri (koyu veya parantez içinde) ev stiliyle eşleşir.
Sunum öncesi şekil kontrol listesi
Gönder tuşuna basmadan önce rakamları bir kez yürüyün:
- Sırayla (veya derginin izin verdiği sırayla) belirtilen her ana rakam.
- Etiketli paneller; çubukları önemli oldukları yere ölçeklendirin.
- Kantitatif panellerde JPEG karmaşası yok.
- Ek derler; S-numaraları yeniden karıştırılmadı.
- Renk politikası kontrol edildi; dosya boyutları portal sınırlarının altında.
- Kaynak görselleri ve komut dosyaları hâlâ proje veya laboratuvar arşivinde bulunabilir.
Western’ler, jeller ve kontrast
PDF için lekeleri aşırı işlemeyin. Dergiler ve okuyucular kontrastı izliyor oyunlar. Ham dosyaları laboratuvar arşivinde tutun ve kullanılan nicelik. Panelleri yeniden düzenlerseniz her metin içi paneli güncelleyin Aynı gün mektup, “sonra” değil.
Filmler ve etkileşimli ekler
Dergi filmlere izin verdiğinde, onları talimat verdikleri şekilde yayınlayın ve bir PDF’de hala artı başlık. Kişisel bulut bağlantısına bağlı kalmayın mezun olduktan sonra ölür.
Rakamlar bu yazıların omurgasını oluşturuyor. LaTeX yalnızca çerçevedir. Emin olun çerçeve, teslim edilmeden önceki gece başarısız olan şey değildir.