7 min read

生物學與生命科​​學論文：圖表、多面板和合著者

用於濕實驗室和計算生物學的實用 LaTeX：多面板圖形、解析度、補充、統計符號和協作，而不會相互覆蓋。

生命科學手稿以圖形為先。審稿者在審閱之前先瀏覽一下盤子 讀你的散文，所以人物必須在不揮手的情況下表達主張 標題。如果你把數字視為一流的話，LaTeX 就能很好地處理這個問題 專案文件，而不是凌晨 2 點補充之前貼上的內容 截止日期。

濕實驗室和計算小組遇到了同樣的混亂：面板沒有共享 比例尺、印跡上的 JPEG 偽影、無法編譯的補充以及 十幾位合著者編輯一個段落。下面是實際有效的。

多面板圖形

審稿者期望在一個標題下有 (a)(b)(c) 個小組。您可以：

  1. 在 TeX 之外建造板（Illustrator、Inkscape、Fiji 導出）並刪除 在單一 PDF 或 PNG 中，或者
  2. 當每個面板都是自己的檔案時，在 TeX 中使用 subcaption 進行組裝：
\usepackage{subcaption}
\begin{figure}[htbp]
  \begin{subfigure}{0.48\textwidth}
    \includegraphics[width=\linewidth]{a.pdf}
    \caption{Control}\label{fig:exp-a}
  \end{subfigure}\hfill
  \begin{subfigure}{0.48\textwidth}
    \includegraphics[width=\linewidth]{b.pdf}
    \caption{Treatment}\label{fig:exp-b}
  \end{subfigure}
  \caption{Overall experiment.}\label{fig:exp}
\end{figure}

仅当期刊样式时，才可在文本中参考如图~\ref{fig:exp}a 所示的面板 允許它。許多場館更喜歡採用一種方案的“圖 2A” 無處不在。關於該模式的更多資訊： 面板 a、b、c。

一致地命名檔案（fig03_western_a.pdf），這樣就沒有人發明 final_gel_NEW.png 提交週。

解析度、色彩和檔案格式

將顯微鏡檔案儲存為高解析度 TIFF 或 PDF。對於紙本 PDF 本身，使用向量圖形原理圖和足夠 dpi 的 PNG/PDF 柵格資料。在線註釋和凝膠上跳過 JPEG。壓縮偽影 即使實驗很好，也被視為草率的科學。

在設計六色調色板之前檢查顏色費用和列印規則 僅適用於已校準的顯示器。有些期刊需要 CMYK；有些期刊需要 CMYK；有些期刊需要 CMYK。其他人轉換 不問就壞了。當他們請求金鑰的灰階安全版本時 數字，給他們那些。

將比例尺和強度單位放在面板上，而不僅僅是在標題中。如果 生產重新佈局數字，嵌入式比例尺得以保留；僅標題註釋 通常不會。

原理圖與資料面板

將「通路卡通」與「印跡定量」分開。 卡通可以是 TikZ 或外部向量藝術。數據面板應靠近 分析匯出，以便您可以在審閱者需要時重新產生它們 不同的標準化。請注意標題註釋中的分析腳本路徑或 當期刊允許時，可重複性補充。

仍然可以編譯的補充

巨大的桌子、額外的凝膠和電影劇照都屬於有自己的補充品 文件或明確的附錄。一些可以避免頭痛的規則：

如果主文件和補充文件共用一個編譯，標籤必須是唯一的。如果他們是 單獨的項目，用純文字寫“圖S3”並且不依賴\ref 跨 PDF。保留一個簡短的列表，列出主要文本聲明所指向的內容 補充物品，所以沒有任何漂移。

未編譯提交週數的補充仍然是您的 即使主 PDF 看起來很乾淨，也會出現問題。

多作者混亂

生物学论文通常有许多具有不同 LaTeX 技能水平的合著者。擁有 按部分（results.tex、methods.tex、figs.tex）的文件，合并 Git，并决定谁维护.bib（一个人或一个共享的 Zotero 组） 出口）。

對於協作者來說，本地專案資料夾比雲端更容易壓縮 他們畢業後就失去了參與計畫的機會。真正的 Git 歷史勝過電子郵件 有人轉換回來的名為「manuscript_JM_edits_FINAL.docx」的附件 手動轉換為 TeX。編譯成功後檢查點；合併時恢復 出問題了；保留私人遙控器。

如果某些合著者只編輯 Word，請為他們匯出 DOCX 或 PDF 並保留“.tex” 作為真理的來源。參見 只講 Word 的合著者。

方法和統計符號

定義一次統計宏，這樣 p 值就不會同時顯示為「$p$」和 同一篇論文中的「p=」：

\newcommand{\pvalue}[1]{$p = #1$}
\newcommand{\ci}[2]{95\% CI $[#1, #2]$}

在方法或表格中說明檢定、n 和多重比較校正 註釋，不僅在生產中被裁剪的人物圖例中。密集 論文受益於簡短的符號清單。即時引用/引用檢查 研究編輯在審閱者之前捕獲已刪除面板的“\ref”。

帶有聲明的標題

一個好的標題說明了測量的內容、在什麼系統中以及讀者的目的 應該注意。避免「查看文字」。不要將方法轉儲到標題中 屬於方法部分。面板字母（粗體或括號）應 搭配房屋風格。

提交前圖表清單

在點擊提交之前，先遍歷一下數字：

  • 依序引用的每個主要人物（或期刊允許的任何順序）。
  • 面板貼有標籤；重要的比例尺。
  • 定量面板上沒有 JPEG 混亂。
  • 補充編譯； S號尚未重新洗牌。
  • 檢查顏色政策；門戶限制下的檔案大小。
  • 來源影像和腳本仍然可以在專案或實驗室檔案中找到。

西部片、凝膠和對比

不要過度處理 PDF 的印跡。期刊和讀者註意對比 遊戲。將原始文件保存在實驗室存檔中，並發送與實際情況相符的面板 使用的量化。如果重新排列面板，請更新每個文字內面板 當天寫信，而不是「稍後」。

電影與互動補充品

當期刊允許播放電影時，請按照他們的指導方式託管它們，並放置 仍然在 PDF 中添加標題。不要依賴個人雲端鏈接 畢業後去世。

數字是這些論文的支柱。 LaTeX 只是框架。確保 框架並不是提交前一天晚上失敗的。

所有貼文