临床和资助写作:隐私、可追踪草稿和离线 LaTeX
为什么医学、公共卫生和拨款作者关心草稿的存储位置,以及使用真正的 Git、离线编译和无帐户的本地研究编辑如何适应审阅周期。
临床手稿和拨款叙述通常包括敏感细节,甚至 在去识别化最终完成之前。将每次击键都交给第三方 编辑器既是一种政策决定,也是一种工具偏好。 IRB、数据使用 协议,医院 IT 并不关心云编辑器是否方便 晚上 11 点。
这篇文章是关于起草和排版的,你可以向他们解释 合规性。将其视为工作流程建议,而不是法律审查。
普通文件更容易推理
一个包含“.tex”和数字的文件夹可以位于加密磁盘、医院中 笔记本电脑图像,或气隙机器。您可以将合规性指向一条路径。 浏览器项目需要信任供应商的访问模型、导出路径和 子处理者列表。
Oleafly 的构建是 故意方式:没有帐户,没有产品遥测,项目作为普通文件夹 使用真正的 Git 存储库。 隐私页面 很短,因为 文档不需要 Oleafly 服务器即可存在。网络是为了你的行动 take(包、可选的引文查找、托管人工智能(如果启用的话)、GitHub), 并非针对草稿的每次击键。
如果政策禁止云人工智能,请关闭助手或将其指向本地 模型。编辑器、编译循环和 Git 仍然可以工作。
无需使用 Word 即可跟踪更改
格兰特 PI 仍然要求“跟踪变更”。在 LaTeX 领域,这通常意味着 Git 历史记录以及合著者的 PDF 注释,或者简短的 Word 导出 拒绝安装任何东西的人。将“.tex”保留为事实来源; 请参阅只讲 Word 的合著者。
在 Oleafly 中,每个项目从第一天起就是一个 Git 存储库:自动检查点 成功编译和空闲编辑后,并排差异,一键式 恢复,当您需要私人遥控器时可选 GitHub。你可以分叉整个 将应用程序打包到第二个项目(完整历史)中以尝试冒险的削减 而不触及提交副本。如果您使用可选的人工智能助手,它 第一次编辑之前的检查点,只有通过批准才能进行更改 差异。
名称在目标或部分之后提交(aim2-methods-cut),以便 PI 可以略读
无需像软件工程师那样阅读差异即可了解历史。
离线在医院很有用
临床网络会阻止随机 SaaS 域。本地编译器不断写入 可能在 EHR 会话之间。 Oleafly 在应用程序中提供了 Tectonic(和 Typst); 包首次使用后会缓存,离线模式可以拒绝网络 编译器。拼写检查和语法在散文上本地运行(它们跳过命令并 数学)。这些是医院 IT 通常关心的限制,因此本地 研究编辑经常出现。
当您修复页面限制时,源代码旁边的 SyncTeX 和 PDF 很重要 在 Wi-Fi 不可靠的护理站计算机上。
模板、页数限制和印前检查
NIH 风格和基础模板涉及边距、字体和页码。 几何和字体包比巧妙的宏更重要。编译为 PDF 并 每次重大剪辑后检查页数,而不是门户网站前一天晚上 关闭。当合适时,从图库中的已知模板开始;仍然匹配 当前字体、边距和结构的 FOA(具体目标为一页 表示一页)。
当 PDF 必须经得起机器阅读器的考验(简历、某些机构 门户),预检显示结构和解析器式提取结果 在您提交之前。这些是您可以阅读并采取行动的启发式风险信号。
多 PI 协作
按部分或目标拥有自己的文件。一个人拥有主“.bib”或共享 Zotero集团出口。就合著者是否编辑 TeX 或返回 PDF 注释达成一致。 仅在政策需要时才在经批准的机构 Git 主机上使用私有遥控器 它;并非所有拨款草案都属于公共 GitHub。
参考书目管理器
共享 Zotero 组导出多个 PI 可以刷新的“.bib”。导入到
项目,添加新引用时粘贴 DOI,并验证缺失的字段
在提交之前,年份不会在组装的 PDF 中显示为“[?]”:
BibTeX 验证器。 Oleafly 完成并检查
当你写作时,根据项目参考书目的引用键,太糟糕了
\cite 键在日志出现之前出现。
数字和 PHI
切勿将可识别的患者数据放入用于特定目的的图表或标题中。 回购其他人可以克隆。使用去识别化的原理图。仍然存储任何东西 在与临床数据集相同的控制下敏感,而不是紧邻 公共方法图。
这不是什么
本地优先仍需接受 IRB 审查、数据使用协议和 去识别化。打开托管 AI 或推送遥控器,一些字节会离开 机器根据这些服务的政策。本地优先更改的是默认值 起草敏感叙述的路径:您控制的文件夹、编辑器 离线运行,您可以恢复历史记录,而无需向供应商询问 出口。
实用的启动设置
1、创建本地项目;一旦包被缓存就启用离线编译。 2. 除非政策和团队就提供商达成一致,否则不要使用人工智能。 3. 仅在经批准的主机上使用专用遥控器。 4. 章节所有权和单一书目所有者。 5. 在每次对目标和研究策略进行重大削减后进行页数检查。
写得就像合规官员会询问草稿在哪里一样。如果答案 是“加密笔记本电脑上的文件夹,Git 历史记录本地,可选私有 远程”,你的状况比“我们从未使用过的服务帐户”更好 已审查。”