Klinik ve hibe yazımı: gizlilik, izlenebilir taslaklar ve çevrimdışı LaTeX

Klinik yazılar ve bağış açıklamaları sıklıkla hassas ayrıntılar içerir. Kimlik gizleme nihai sonuçlanmadan önce. Her tuş vuruşunu üçüncü tarafa vermek editör bir araç tercihi olduğu kadar bir politika kararıdır. IRB’ler, veri kullanımı anlaşmalar ve hastane BT’si bir bulut düzenleyicinin uygun olup olmadığını umursamıyor 23:00.

Bu yazı, açıklayabileceğiniz bir şekilde taslak hazırlama ve dizgi ile ilgilidir. uyumluluk. Bunu yasal inceleme olarak değil, iş akışı tavsiyesi olarak değerlendirin.

Düz dosyalar hakkında akıl yürütmek daha kolaydır

‘.Tex’ ve rakamlardan oluşan bir klasör, şifrelenmiş bir diskin, bir hastanenin içinde bulunabilir dizüstü bilgisayar görüntüsü veya hava boşluklu bir makine. Uyumluluğu bir yola yönlendirebilirsiniz. Tarayıcı projeleri, satıcının erişim modeline, dışa aktarma yoluna ve alt işlemciler listesi.

Oleafly şu şekilde oluşturulmuştur: bilerek: hesap yok, ürün telemetrisi yok, projeler sıradan klasörler halinde gerçek bir Git deposuyla. Gizlilik sayfası kısadır çünkü belgenin var olması için bir Oleafly sunucusuna ihtiyacı yoktur. Ağ, gerçekleştireceğiniz eylemler içindir take (paketler, isteğe bağlı alıntı arama, etkinleştirirseniz barındırılan yapay zeka, GitHub), taslağın her tuş vuruşu için değil.

Politika bulut yapay zekasını yasaklıyorsa asistanı kapalı bırakın veya yerel bir yere yönlendirin modeli. Düzenleyici, derleme döngüsü ve Git hala çalışıyor.

Değişiklikleri Word’de yaşamadan takip edin

Hibe PI’leri hâlâ “değişiklikleri takip etme” talebinde bulunuyor. LaTeX ülkesinde bu genellikle şu anlama gelir: Git geçmişi artı ortak yazarlardan PDF yorumları veya kısa bir Word dışa aktarımı herhangi bir şey kurmayı reddeden kişi. Gerçeğin kaynağı olarak “.tex”i koruyun; bkz. yalnızca Word konuşan ortak yazarlar.

Oleafly’da her proje ilk günden itibaren bir Git deposudur: otomatik kontrol noktaları Başarılı derlemelerden ve boşta yapılan düzenlemelerden sonra, yan yana farklar, tek tıklamayla özel bir uzaktan kumanda istediğinizde isteğe bağlı GitHub’u geri yükleyin. Bir bütünü çatallayabilirsin riskli bir kesimi denemek için uygulama paketini ikinci bir projeye (tam geçmiş) aktarın Gönderim kopyasına dokunmadan. İsteğe bağlı yapay zeka asistanını kullanırsanız ilk düzenlemeden önce kontrol noktaları ve yalnızca onay yoluyla değişiklik yapılır farklar.

Bir PI’nin gözden geçirebilmesi için ad, amaçlardan veya bölümlerden sonra işlenir (“aim2-methods-cut”) Bir yazılım mühendisi gibi farkları okumadan geçmiş.

Çevrimdışı hastanelerde faydalıdır

Klinik ağlar rastgele SaaS alanlarını engeller. Yerel bir derleyici yazmaya devam ediyor EHR oturumları arasında mümkündür. Oleafly, uygulamada Tectonic’i (ve Typst’i) gönderir; Paketler ilk kullanımdan sonra önbelleğe alınır ve çevrimdışı mod, ağı derleyici. Yazım denetimi ve dilbilgisi düzyazıda yerel olarak çalışır (komutları atlarlar ve matematik). Bunlar hastane BT’sinin genellikle önemsediği kısıtlamalardır, dolayısıyla yerel araştırma editörleri sık sık karşımıza çıkıyor.

Sayfa sınırını düzeltirken kaynağın yanındaki SyncTeX ve PDF önemlidir güvenilmez Wi-Fi bağlantısına sahip bir bakım istasyonu bilgisayarında.

Şablonlar, sayfa sınırları ve ön kontrol

NIH tarzı ve temel şablonlar kenar boşlukları, yazı tipleri ve sayfa başlıkları ile ilgilidir. Geometri ve yazı tipi paketleri akıllı makrolardan daha önemlidir. PDF’ye derleyin ve sayfa sayısını portaldan önceki gece değil, her büyük kesintiden sonra kontrol edin kapanır. Uygun olduğunda galerideki bilinen bir şablondan başlayın; hala eşleşiyor yazı tipleri, kenar boşlukları ve yapı için mevcut FOA (Tek sayfa olarak Özel Amaçlar) bir sayfa anlamına gelir).

PDF’nin makine okuyucusunda hayatta kalması gerektiğinde (özgeçmişler, bazı kurumsal portalları), Ön Kontrol yapıyı ve ayrıştırıcı tarzı çıkarma bulgularını gösterir göndermeden önce. Bunlar okuyabileceğiniz ve üzerinde işlem yapabileceğiniz buluşsal risk sinyalleridir.

Çoklu PI işbirliği

Bölümlere veya amaca göre kendi dosyalarınıza sahip olun. Bir kişi ana `.bib’in sahibidir veya paylaşılan Zotero grup ihracatı. Ortak yazarların TeX’i mi düzenleyeceğini yoksa PDF yorumlarını mı döndüreceğini kabul edin. Politika gerektirdiğinde yalnızca onaylı kurumsal Git ana bilgisayarlarındaki özel uzaktan kumandalar o; Her hibe taslağı herkese açık GitHub’a ait değildir.

Kaynakça yöneticileri

Paylaşılan Zotero grupları, birden fazla PI’nin yenileyebileceği bir .bib'i dışa aktarır. İçeri aktar projeye yeni alıntılar eklediğinizde DOI'leri yapıştırın ve eksik alanları doğrulayın sunulmadan önce yıllar birleştirilmiş PDF'de [?]olarak görünmüyor: [BibTeX doğrulayıcı](/tools/bibtex-validator/). Oleafly tamamlar ve kontrol eder Proje bibliyografyasına karşı alıntı anahtarları yazarken çok bozuk\cite’ anahtarları günlükten önce görünür.

Rakamlar ve PHI

Tanımlanabilir hasta verilerini hiçbir zaman belirli bir amaca yönelik rakamlara veya altyazılara koymayın. repo diğerleri klonlayabilir. Kimliksiz şemalar kullanın. Herhangi bir şeyi hareketsiz olarak saklayın klinik veri seti ile aynı kontroller altında hassastır, genel yöntemler diyagramı.

Bu ne değil

Yerel öncelikli hâlâ IRB incelemesi, veri kullanım anlaşmaları ve kimliksizleştirme. Barındırılan yapay zekayı açın veya uzaktan kumandaya basın; bazı baytlar bu hizmetlerin politikaları kapsamında makine. Hangi yerel öncelikli değişiklikler varsayılandır Hassas bir anlatı taslağı hazırlamanın yolu: kontrol ettiğiniz bir klasör, kontrol ettiğiniz bir editör çevrimdışı çalışır ve satıcıdan izin istemeden geçmişi geri yükleyebilirsiniz. ihracat.

Pratik başlangıç ​​kurulumu

1. Yerel bir proje oluşturun; paketler önbelleğe alındıktan sonra çevrimdışı derlemeyi etkinleştirin.
2. Politika ve ekip bir sağlayıcı üzerinde anlaşmaya varmadıkça AI’yı kapalı bırakın.
3. Yalnızca onaylı bir ana bilgisayarda özel uzaktan kumanda.
4. Bölüm sahipliği ve tek bibliyografya sahibi.
5. Amaçlar ve araştırma stratejisine ilişkin her büyük kesintiden sonra sayfa sayımı kontrolleri.

Sanki bir uyum görevlisi taslağın nerede yaşadığını soracakmış gibi yazın. Cevap ise “şifrelenmiş dizüstü bilgisayarda bir klasör, Git geçmişi yerel, isteğe bağlı özel uzak,” asla kullanmadığımız bir hizmetteki hesaptan daha iyi durumdasınız gözden geçirildi.“