Статті з хімії в LaTeX: формули, схеми та одиниці СІ

Хіміки зазвичай з’являються в LaTeX з однієї з двох причин: журнал наполягає, або співавтор уже працює таким чином. У будь-якому випадку больові точки виглядають знайомі: схеми реакцій, мітки ізотопів, таблиці умов та a бібліографія, наповнена журналами та патентами.

Цей посібник охоплює звіти бакалаврату через перші подання журналу. Це буде не замінює ChemDraw для комплексних натуральних продуктів. Воно збереже рукопис і експериментальний розділ від бойового компілятора.

Реакції з mhchem

mhchem — звичайна відповідь для формул і реакцій:

\usepackage[version=4]{mhchem}
\ce{CO2 + C -> 2CO}
\ce{^{14}C}
\ce{H2SO4}
\ce{Fe^2+ <=>[\ce{H2O}] Fe^3+}

Закріпіть версію 4, щоб синтаксис не змінювався між співавторами або між Overleaf і локальне встановлення TeX. Довший крок: хімічні формули.

Багатокрокові схеми з реагентами над і під стрілкою потребують більше ніж вбудований \ce. mhchem обробляє формули; Макет часто потребує схеми журналу оточення чи зовнішня фігура. Не запихайте двадцятиступеневий тотальний синтез у низку вбудованих ліній хімії.

Конструкції: хемфіг або зовнішні малюнки

chemfig малює прості структури в чистому TeX і зберігає все векторно-локальний. Комплексні натуральні продукти майже завжди кращі, ніж ChemDraw, Marvin або подібний, експортований у PDF, потім \includegraphics. Надаю перевагу векторному формату PDF над скріншотом PNG, щоб лінії зв’язку залишалися чіткими під час друку та у двох стовпцях макет.

Назвіть файли за складеним ID (cmpd-12.pdf). Збережіть редагований джерело ChemDraw в архіві лабораторії, навіть якщо git зберігає лише PDF, який міститься в статті.

Експериментальні розділи та довгі таблиці

Таблиці умов (температура, розчинник, вихід, завантаження каталізатора) працюють добре з booktabs і часто siunitx для числових стовпців:

\usepackage{booktabs,siunitx}
\begin{tabular}{l S S}
  \toprule
  {Entry} & {T / \degreeCelsius} & {Yield / \percent} \\
  \midrule
  1 & 25 & 72 \\
  \bottomrule
\end{tabular}

Якщо таблиця займає більше сторінки, перейдіть на longtable до кінцевого терміну тиждень, а не після того, як журнал скаржиться на шрифти 7pt. Підпис має сказати що означає “вихід” (ізольований, ЯМР, ГХ), тому читачі не здогадуються.

Одиниці вимірювання та фрагменти спектроскопії

Виберіть стиль одиниці та дотримуйтеся його: siunitx або вручну \mathrm, якщо група вже домовилися про це. ЯМР та HRMS фрагменти в експериментальних секціях є часто звичайний текст із обережним інтервалом. Не винаходьте тендітну макромову середина статті, якщо лабораторія вже не ділиться одним.

Повідомляйте значні цифри так, як це робить блокнот. LaTeX із задоволенням надрукує помилкова точність, якщо ви її введете.

Схеми проти фігур

Багато хімічних журналів відрізняють схеми (реакції) від малюнків (ділянок, ORTEP, спектри). Використовуйте середовища, які поставляє клас журналу (схема, фігура), тому нумерація відповідає виробництву. Перехресне посилання з \ref і стабільне мітки (sch:reduction, fig:ortep-1).

Безпека протягу

Неопубліковані маршрути та промислові партнери перетворюють хмарні редактори на a питання політики, а не лише питання зручності. Зберігання .tex і цифр як звичайні файли на диску з Git нудно в корисний спосіб.

Oleafly є місцевим дослідницький редактор: комплектні компілятори, перевірка посилань і цитат для всього проекту, офлайн правопис і граматика лише в прозі (тому \ce і ключі цитування не позначаються як “друкарські помилки”), реальні контрольні точки Git, необов’язковий AI, який редагує лише через схвалення диф. Немає облікового запису. Для існування чернетки не потрібен сторонній редактор. Мережа призначена для пакетів, пошуку цитат або ШІ, якщо ви їх увімкнете.

Цитуйте правильну основну літературу

Бібліографії з хімії сильно залежать від журналів і патентів. Експорт із Zotero або EndNote у .bib зі стабільними ключами, а потім перевірте відсутні поля раніше подання: валідатор BibTeX. Пусті бібліографії майже завжди є помилкою шляху або серверної частини, не пропускаючи цитати.

Стилі журналу відрізняються (ACS, RSC, Springer). Використовуйте стиль бібліографії шаблон поставляється з. Чи не склеюйте цифру та рік автора в одну преамбула.

Співпраця

За можливості володійте розділами окремо. Одна особа володіє .bib. Погодьтеся версія mhchem і формат експорту структури спереду. При кількох експериментальних розділи ростуть паралельно, компілюйте повний PDF щотижня, тому інтеграція сюрпризи з’являються рано.

Контрольний список перед поданням

Варто останнього пропуску:

• mhchem версія закріплена; формули компілювати без попереджень ви були ігнорування.
• Структури є векторними, де це можливо; складені ідентифікатори відповідають тексту, схемам, і СІ.
• Таблиці використовують стиль трьох правил; узгоджені одиниці; врожайність, визначена в підписі або нотатки.
• Нумерація схем/малюнків відповідає класу журналу.
• .bib перевірено; стиль відповідає шаблону.
• Конфіденційні маршрути залишаються в локальній папці з контролем доступу, який відповідає lab політики.

SI та контрольні списки журналів

Багато хімічних журналів публікують авторські контрольні списки (роздільна здатність графіки, TOC графічний розмір, складена характеристика). Перегляньте PDF-файл, перш ніж малювати схеми. Неправильне співвідношення сторін графіки TOC є дурною причиною для адміністратора відмова.

Додаткова інформація

SI часто має власний шаблон або правила заголовків. Зберігайте джерела SI у тому самому місці repo як основний документ із чіткими назвами файлів. Коли журнал вимагає повн характеристика, перевірити, що кожне складене число в основному тексті дійсно відображається в СІ.

Хімічне форматування складне, оскільки об’єкти щільні. Отримайте реакції і таблиці праворуч, і експериментальна частина читається як ретельна робота, а не a вставити з блокнота PDF.